Après avoir obtenu son indépendance de l'Espagne en 1821, le Nicaragua s'associa aux quatre autres nations (Salvador, Costa Rica, Guatemala et Honduras) qui constituèrent alors la Fédération de l'Amérique centrale. Son drapeau, adopté le 4 septembre 1908, est pratiquement le même que celui utilisé par cette fédération de 1823 à 1839, l'année de sa dissolution. Les deux bandes bleues séparées par une bande blanche évoquent la situation géographique du Nicaragua, baigné d'un côté par la Mer des Caraïbes et de l'autre par l'Océan Pacifique. Les armes de l'Etat, situées au centre de la bande blanche, s'inspirent elles-mêmes de celles de l'ancienne fédération. Le triangle est symbole de justice, d'égalité et de vérité. L'arc-en-ciel et le bonnet phrygien représentent respectivement l'espérance et la liberté. Les cinq volcans qui se dressent entre deux mers rappellent le nombre des états qui faisaient partie de la fédération.