Envahie au IXème siècle par les arabes, Malte fut ensuite conquise par les normands du comte Roger de Sicile en 1090. A partir de cette date, les couleurs du comte de Sicile (blanc et rouge) ont toujours été associées à l'histoire maltaise, et ce sont elles qui furent choisies comme emblème national après la proclamation de l'indépendance en 1964. En 1943, la Croix de Saint-Georges, qui figure au canton du drapeau, a été décernée à l'île par le roi George VI d'Angleterre (1895-1952) en récompense du comportement héroïque de la population pendant la Seconde Guerre mondiale. Sur la croix figure un médaillon représentant Saint-Georges et portant la devise "Pour la Bravoure".