Selon la légende, le roi danois Valdemar 2 (1170-1241), à la veille de la bataille de Lyndanisse, vit apparaître dans le ciel sombre une croix blanche ; le monarque interpréta cette vision comme un signe du Christ lui ordonnant de massacrer les malheureux estoniens, ce qu'il fit proprement le lendemain.
De cette légende est née la Croix Scandinave que portent également les drapeaux du Danemark, d'Islande, de Norvège et de Suède. A l'origine, la croix était de forme carrée, mais au fil des siècles, un de ses bras a été allongé. Le drapeau islandais fut adoptée en 1915 alors que le pays ne devint une république indépendante qu'en 1944.
La croix rouge symbolise les éruptions de lave et la blanche les glaciers et les montagnes ; le fond bleu représente le ciel, la mer et les chutes d'eau.