Utilisés dès la fin du 12ème siècle, le blanc et le rouge furent choisis comme emblèmes par le mouvement indonésien de libération nationale en 1922. Ces deux couleurs devinrent officiellement celles du drapeau national en 1945, au moment de la proclamation d'indépendance. Le blanc incarne la pureté et la justice, quant au rouge, il symbolise le courage et la liberté.